Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX29Q8TEQ0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX29Q8TEQ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms