Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD1Q8NHV4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD1Q8NHV4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms