Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRACR2BQ8N4Y2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms