Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SVBPQ8N300 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SVBPQ8N300 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms