Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYCP3Q8IZU3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYCP3Q8IZU3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms