Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2LQ8IYA6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2LQ8IYA6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms