Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HERC6Q8IVU3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms