Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT28Q7Z3Y7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT28Q7Z3Y7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms