Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SMIM5Q71RC9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM5Q71RC9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms