Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q71RC1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q71RC1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q71RC1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q71RC1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q71RC1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q71RC1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q71RC1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms