Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBR3Q6ZT12 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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