Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC73Q6ZRK6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC73Q6ZRK6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms