Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN03

LINC00322, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00322, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00322Q6ZN03 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00322Q6ZN03 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms