Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRSAM1Q6UWE0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms