Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C16orf54Q6UWD8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C16orf54Q6UWD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms