Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC4A10Q6U841 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC4A10Q6U841 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms