Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC171Q6TFL3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms