Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF880Q6PDB4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms