Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC41PQ6P2S7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTC41PQ6P2S7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms