Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-215ENST00000618487 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.139e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MAGOHB-206ENST00000543929 841 ntTSL 37.94□□□□□ -1.149e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-203ENST00000593650 577 ntTSL 47.89□□□□□ -1.159e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ATRIP-206ENST00000635084 545 ntTSL 47.86□□□□□ -1.159e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF432-206ENST00000600368 764 ntTSL 57.85□□□□□ -1.151e-18■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-202ENST00000391795 2698 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.169e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.179e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 LIN52-203ENST00000554289 271 ntTSL 37.57□□□□□ -1.23e-27■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PSMD13-210ENST00000529679 507 ntTSL 27.56□□□□□ -1.29e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP32-206ENST00000527272 5289 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.29e-11■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-18■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TMEM144-201ENST00000296529 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.219e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF432-201ENST00000221315 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.221e-18■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TTN-AS1-256ENST00000620591 797 ntTSL 57.36□□□□□ -1.239e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-206ENST00000597747 704 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.239e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MAGOHB-211ENST00000625272 319 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.249e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-214ENST00000618049 2284 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.269e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ARHGEF12-203ENST00000525222 2795 ntTSL 57.13□□□□□ -1.279e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-208ENST00000598071 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.289e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.289e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AC112493.1-202ENST00000436019 673 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.289e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.289e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.299e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.319e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 POLR2G-207ENST00000531996 660 ntTSL 36.77□□□□□ -1.339e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.349e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PDHX-208ENST00000533550 584 ntTSL 46.54□□□□□ -1.369e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TDP1-214ENST00000556063 1076 ntTSL 1 (best)6.41□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.419e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TTN-AS1-234ENST00000589842 635 ntTSL 56.2□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TTN-AS1-214ENST00000585358 760 ntTSL 56.2□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF615-210ENST00000599177 4122 ntTSL 1 (best)6.2□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AIDA-206ENST00000497112 717 ntTSL 56.15□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 STAMBP-208ENST00000478946 955 ntTSL 36.02□□□□□ -1.459e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.529e-11■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 OTUD6B-204ENST00000524027 1330 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.529e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 YME1L1-205ENST00000427324 775 ntTSL 35.45□□□□□ -1.549e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.561e-9■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 AP3S1-202ENST00000395548 1180 ntTSL 1 (best)5.26□□□□□ -1.579e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 SETX-203ENST00000464133 631 ntTSL 24.89□□□□□ -1.639e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.669e-10■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.951e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TTN-AS1-208ENST00000450692 723 ntTSL 52.82□□□□□ -1.969e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MAGOHB-207ENST00000544176 559 ntTSL 22.82□□□□□ -1.969e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 TRPM7-205ENST00000560638 2518 ntTSL 1 (best)2.73□□□□□ -1.979e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -21e-7■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MKI67-205ENST00000484853 733 ntTSL 22.51□□□□□ -2.019e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.011e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR3-203ENST00000503343 487 ntTSL 32.2□□□□□ -2.069e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 VPS13A-208ENST00000423463 2702 ntTSL 22□□□□□ -2.099e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR3-204ENST00000505715 520 ntTSL 41.7□□□□□ -2.149e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-217ENST00000583160 365 ntTSL 51.68□□□□□ -2.149e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MAIP1-204ENST00000469156 305 ntTSL 31.67□□□□□ -2.149e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF121-203ENST00000591447 546 ntTSL 31.62□□□□□ -2.159e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AMBRA1-208ENST00000529558 483 ntTSL 51.56□□□□□ -2.161e-18■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ALDH7A1-206ENST00000476328 484 ntTSL 31.41□□□□□ -2.182e-6■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR3-211ENST00000515541 804 ntTSL 31.26□□□□□ -2.219e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 EXOC5-209ENST00000556629 693 ntTSL 30.81□□□□□ -2.289e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 FAM76B-213ENST00000545813 625 ntTSL 20.29□□□□□ -2.369e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 FAM76B-209ENST00000541418 553 ntTSL 30.19□□□□□ -2.389e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 COPS3-211ENST00000495640 333 ntTSL 30.12□□□□□ -2.399e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 GLMN-202ENST00000463560 734 ntTSL 50.01□□□□□ -2.419e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.429e-10■■■■■ 36.7
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