Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms