Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CARMIL2Q6F5E8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms