Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATG16L1Q676U5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATG16L1Q676U5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms