Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF123Q5XPI4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF123Q5XPI4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms