Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms