Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD5Q5TGI4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SAMD5Q5TGI4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms