Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SOGA3Q5TF21 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms