Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LDLRAD1Q5T700 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDLRAD1Q5T700 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms