Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BEND3Q5T5X7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BEND3Q5T5X7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms