Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYCP2LQ5T4T6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP2LQ5T4T6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms