Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CEP78Q5JTW2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CEP78Q5JTW2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms