Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI3KQ59H18 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNI3KQ59H18 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms