Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RPL39P5Q59GN2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms