Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DCAF6Q58WW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DCAF6Q58WW2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms