Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDK2Q58EX2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SDK2Q58EX2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms