Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA8Q53HL2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms