Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL22Q53GT1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL22Q53GT1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms