Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms