Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q499Y3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q499Y3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q499Y3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q499Y3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms