Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY8

ARL13B, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL13BQ3SXY8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ARL13BQ3SXY8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL13BQ3SXY8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms