Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KLHL38Q2WGJ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms