Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CEACAM16Q2WEN9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEACAM16Q2WEN9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEACAM16Q2WEN9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEACAM16Q2WEN9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CEACAM16Q2WEN9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEACAM16Q2WEN9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEACAM16Q2WEN9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEACAM16Q2WEN9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms