Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SKOR2Q2VWA4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKOR2Q2VWA4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms