Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TYSND1Q2T9J0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TYSND1Q2T9J0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms