Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSPP1Q1MSJ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSPP1Q1MSJ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms