Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RTL8BQ17RB0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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