Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RPE65Q16518 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RPE65Q16518 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RPE65Q16518 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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RPE65Q16518 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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RPE65Q16518 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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RPE65Q16518 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPE65Q16518 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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