Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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TNXAQ16473 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TNXAQ16473 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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