Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCN9AQ15858 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCN9AQ15858 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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