Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPTX1Q15818 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPTX1Q15818 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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